As torres gêmeas distintas, que são um destaque no horizonte de Vyšehrad, foram construídas em 1903, após uma reforma neogótica da basílica feita pelo arquiteto Josef Mocker na década de 1880. O interior da igreja é um amálgama colorido de afrescos art nouveau pintados por vários artistas tchecos.
A Basílica de São Pedro e São Paulo está entre os exemplos mais impressionantes da arquitetura Art Nouveau eslava da cidade. É difícil acreditar que a magnífica capela não seja o primeiro local que as pessoas pedem para ir quando visitam Praga. Os amplos murais art nouveau que cercam esse edifício são de tirar o fôlego e são imperdíveis para quem visita Praga. A visita também funciona como uma lição histórica sobre o povo eslavo, a sociedade tcheca e até mesmo a arte.